គ្រោងការណ៍រចនានិងដំណោះស្រាយនៃខ្សែសង្វាក់ polypeptide peptide

I. សង្ខេប
Peptides គឺជាម៉ាក្រូម៉ូលេគុលពិសេស ដែលលំដាប់របស់វាមិនធម្មតានៅក្នុងលក្ខណៈគីមី និងរូបវន្តរបស់វា។សារធាតុ peptides ខ្លះពិបាកក្នុងការសំយោគ ខណៈខ្លះទៀតងាយស្រួលសំយោគ ប៉ុន្តែពិបាកក្នុងការបន្សុត។បញ្ហាជាក់ស្តែងគឺថា peptides ភាគច្រើនគឺរលាយបន្តិចក្នុងដំណោះស្រាយ aqueous ដូច្នេះនៅក្នុងការបន្សុតរបស់យើង ផ្នែកដែលត្រូវគ្នានៃ peptide hydrophobic ត្រូវតែត្រូវបានរំលាយនៅក្នុងសារធាតុរំលាយដែលមិនមែនជា aqueous ដូច្នេះហើយ សារធាតុរំលាយ ឬសតិបណ្ដោះអាសន្នទាំងនេះទំនងជាមិនស៊ីសង្វាក់គ្នាយ៉ាងខ្លាំងជាមួយនឹងការប្រើប្រាស់។ នៃនីតិវិធីពិសោធន៍ជីវសាស្រ្ត ដូច្នេះអ្នកបច្ចេកទេសត្រូវបានហាមឃាត់យ៉ាងតឹងរ៉ឹងពីការប្រើប្រាស់ peptide សម្រាប់គោលបំណងផ្ទាល់ខ្លួនរបស់ពួកគេ ដូច្នេះខាងក្រោមនេះគឺជាទិដ្ឋភាពមួយចំនួននៃការរចនា peptides សម្រាប់អ្នកស្រាវជ្រាវ។

គ្រោងការណ៍រចនានិងដំណោះស្រាយនៃខ្សែសង្វាក់ polypeptide peptide
ទីពីរ ជម្រើសត្រឹមត្រូវនៃ peptides ពិបាកសំយោគ
1. ប្រវែងសរុបនៃលំដាប់ចុះក្រោម
Peptides នៃសំណល់តិចជាង 15 គឺមានភាពងាយស្រួលក្នុងការទទួលបានដោយសារតែទំហំនៃ peptide កើនឡើង និងភាពបរិសុទ្ធនៃផលិតផលឆៅមានការថយចុះ។នៅពេលដែលប្រវែងសរុបនៃខ្សែសង្វាក់ peptide កើនឡើងលើសពី 20 សំណល់ បរិមាណផលិតផលច្បាស់លាស់គឺជាកង្វល់សំខាន់។នៅក្នុងការពិសោធន៍ជាច្រើន វាងាយស្រួលក្នុងការទទួលបានផលប៉ះពាល់ដែលមិនបានរំពឹងទុកដោយបន្ថយចំនួនសំណល់នៅក្រោម 20 ។
2. កាត់បន្ថយចំនួនសំណល់អ៊ីដ្រូហ្វូប៊ីក
Peptides ដែលមានសំណល់ hydrophobic លេចធ្លោជាពិសេសនៅក្នុងតំបន់ 7-12 សំណល់ពី C-terminus ជាធម្មតាបណ្តាលឱ្យមានការពិបាកសំយោគ។នេះ​ត្រូវ​បាន​គេ​មើល​ឃើញ​ថា​ជា​ការ​រួម​បញ្ចូល​មិន​គ្រប់​គ្រាន់​ដោយ​សារ​តែ​សន្លឹក B-fold ត្រូវ​បាន​ទទួល​ក្នុង​ការ​សំយោគ។"ក្នុងករណីបែបនេះ វាអាចមានប្រយោជន៍ក្នុងការបំប្លែងសំណល់វិជ្ជមាន និងអវិជ្ជមានច្រើនជាងពីរ ឬដាក់ Gly ឬ Pro ទៅក្នុង peptide ដើម្បីដោះសោសមាសភាព peptide ។"
3. ការកាត់បន្ថយនៃសំណល់ "ពិបាក"
"មានសំណល់ Cys, Met, Arg និង Try មួយចំនួនដែលជាទូទៅមិនអាចសំយោគបានយ៉ាងងាយស្រួល។"Ser ជាធម្មតានឹងត្រូវបានប្រើជាជម្រើស nonoxidative ទៅ Cys ។
គ្រោងការណ៍រចនានិងដំណោះស្រាយនៃខ្សែសង្វាក់ polypeptide peptide


ទីបី កែលម្អជម្រើសត្រឹមត្រូវនៃសារធាតុរលាយក្នុងទឹក។
1. លៃតម្រូវស្ថានីយ N ឬ C
ទាក់ទងទៅនឹងអាស៊ីត peptides (នោះគឺត្រូវបានចោទប្រកាន់អវិជ្ជមាននៅ pH 7) acetylation (N-terminus acetylation, C terminus តែងតែរក្សាក្រុម carboxyl ដោយឥតគិតថ្លៃ) ត្រូវបានណែនាំជាពិសេសដើម្បីបង្កើនបន្ទុកអវិជ្ជមាន។ទោះជាយ៉ាងណាក៏ដោយសម្រាប់ peptides មូលដ្ឋាន (នោះគឺត្រូវបានចោទប្រកាន់ជាវិជ្ជមាននៅ pH 7) amination (ក្រុមអាមីណូដោយឥតគិតថ្លៃនៅ N-terminus និង amination នៅ C-terminus) ត្រូវបានណែនាំជាពិសេសដើម្បីបង្កើនបន្ទុកវិជ្ជមាន។

2. កាត់បន្ថយ ឬពង្រីកលំដាប់លំដោយ

លំដាប់មួយចំនួនមានអាស៊ីតអាមីណូ hydrophobic មួយចំនួនធំដូចជា Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr និង Ala ជាដើម។ នៅពេលដែលសំណល់ hydrophobic ទាំងនេះលើសពី 50% ពួកវាជាធម្មតាមិនងាយរលាយទេ។វាអាចមានប្រយោជន៍ក្នុងការពង្រីកលំដាប់ ដើម្បីបង្កើនប៉ូលវិជ្ជមាន និងអវិជ្ជមាននៃ peptide បន្ថែមទៀត។ជម្រើសទីពីរគឺកាត់បន្ថយទំហំនៃខ្សែសង្វាក់ peptide ដើម្បីបង្កើនប៉ូលវិជ្ជមាន និងអវិជ្ជមាន ដោយកាត់បន្ថយសំណល់អ៊ីដ្រូហ្វូប៊ីក។ភាគីវិជ្ជមាន និងអវិជ្ជមាននៃខ្សែសង្វាក់ peptide កាន់តែខ្លាំង វាទំនងជាមានប្រតិកម្មជាមួយទឹក។
3. ដាក់ក្នុងសំណល់រលាយក្នុងទឹក។
សម្រាប់ខ្សែសង្វាក់ peptide មួយចំនួន ការរួមបញ្ចូលគ្នានៃអាស៊ីតអាមីណូវិជ្ជមាន និងអវិជ្ជមានមួយចំនួនអាចធ្វើអោយការរលាយក្នុងទឹកមានភាពប្រសើរឡើង។ក្រុមហ៊ុនរបស់យើងសូមផ្តល់អនុសាសន៍ N-terminus ឬ C-terminus នៃ peptides អាស៊ីតដែលត្រូវបានផ្សំជាមួយ Glu-Glu ។ស្ថានីយ N ឬ C នៃ peptide មូលដ្ឋានត្រូវបានផ្តល់ឱ្យហើយបន្ទាប់មក Lys-Lys ។ប្រសិនបើក្រុមដែលគិតថ្លៃមិនអាចដាក់បាន Ser-Gly-Ser ក៏អាចត្រូវបានដាក់នៅក្នុងស្ថានីយ N ឬ C ផងដែរ។ទោះជាយ៉ាងណាក៏ដោយវិធីសាស្រ្តនេះមិនដំណើរការទេនៅពេលដែលភាគីនៃខ្សែសង្វាក់ peptide មិនអាចផ្លាស់ប្តូរបាន។


ពេលវេលាផ្សាយ៖ ឧសភា-១២-២០២៣